Тип мутации в котором количество нуклеотидов, не делящиеся на три удаляются или вставляется в кодирования последовательности, вызывая тем самым изменения в рамках чтения всей последовательности по течению мутации. Эти мутации, может быть вызван некоторыми типами мутагенов или может возникнуть спонтанно.